1989年1月23日静岡県浜松市松島町の天竜川河口から西へ200 mの砂浜に打ち上げられた推定3から4mの雄の個体が発見され、写真記録が撮られたもののその後流失した[4]。これは、日本を含む西部太平洋では初めての記録であった[4]。

1994年11月29日福岡市東区和白浜。メスの個体（死体）が漂着しているのを、バードウォッチングをしていた人物が発見した[7]。メスのメガマウスザメは世界で初めてということもあり注目されたが、子供は見つからなかった。2013年現在も、マリンワールド海の中道においてホルマリン標本が展示されている。

2003年8月7日静岡県御前崎市御前崎沖の駿河湾。巻き網で捕獲。体長4.6 m、体重460 kgのオスの個体だった。沼津港に水揚げされた後、東海大学海洋学部が解剖を実施。その後、東海大学海洋科学博物館において剥製が展示されている。

2005年1月23日三重県度会郡紀勢町錦沖。巻き網で体長5.28 mのメスの個体が捕獲。鳥羽水族館で剥製が展示されている。

2006年5月神奈川県湯河原町沖の相模湾。体長5.6 m、体重1,200 kgのメスの個体。定置網にかかって死亡していた。京急油壺マリンパーク（神奈川県三浦市）で解剖された。

2007年4月19日から、標本として展示されている。2007年6月7日静岡県賀茂郡東伊豆町北川沖の相模灘。定置網でメスが混獲。連絡を受けた下田海中水族館の職員が確認。輸送方法や飼育環境の準備を整えることができないため、飼育は断念。今後の調査のために標識をつけて放流した。海中で元気に泳ぐ姿の撮影に成功したのは世界で2例目、日本では初めて[8]。

2007年7月9日茨城県東沖700 km。巻き網船が体長約4 m、体重450 kgのメスの個体を漁獲。11日に石巻魚市場（宮城県石巻市魚町）に水揚げされた。日本では12例目、世界では40例目となる[9]。

2011年1月14日三重県尾鷲市沖合500 m。14日早朝、約5 mの個体が生きたまま定置網にかかっているのが発見された。15日朝に大阪市の水族館が引き取りに来るまで網に入れたまま泳がせていたが、同日午前6時ごろにいなくなっているのが確認された。網が破られた形跡はなく、網の上を乗り越えたとみられる。鳥羽水族館によると、生きたまま展示されれば世界初だったという[10]。

2014年4月14日静岡県静岡市清水区の倉沢沖で由比漁港所属の第11光洋丸の定置網にかかり、由比漁港に水揚げされた。この個体は世界で58例目、日本では17個体目となる体長約4.4 mのメスで、東海大学海洋学部に運ばれ、外部形体が測定された。5月6日にゴールデンウイークの特別企画として、東海大学海洋科学博物館津波実験水槽前の広場で、東海大学海洋学部　田中彰教授指揮の下、公開解剖された[11]。

2014年12月24日静岡県伊豆の富戸定置網に混獲される。その個体は大きかったため水揚げされず、放流された[12]。2016年4月18日三重県尾鷲市の尾鷲漁港から5キロ沖合の定置網にかかり、同港に水揚げされた。体長は約5 m、体重は約1 t。地元の鮮魚店が落札し、研究用として国の研究機関の冷蔵庫に納品された[13][14]。

2017年5月22日千葉県館山市沖合の定置網にかかり、生きた姿が撮影された。しかし翌日5月23日に死亡が確認された[15]。体長は約5–6 mほど[16]。

2017年5月26日三重県尾鷲市の尾鷲漁港から20 kmの沖合にて、水深約100 mから引き上げた漁船の巻き網にかかっているのが見つかった。奈屋浦港まで運ばれ、鳥羽水族館（三重県鳥羽市）のスタッフがメガマウスと確認した。体長は約5 m[17]。

https://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%A1%E3%82%AC%E3%83%9E%E3%82%A6%E3%82%B9
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↑　これを見る限り　メガマウスの捕獲が 大地震と密接に関係してるとは とても言い難い
近いのは ２０１１年１月１４日のみで　しかも二カ月近く離れている
二か月も前後を探せば、ちょこっと揺れた地震なら 必ず見つかる訳で　結局　都市伝説の域を出ませんな。

┐（ -”-）┌ やれやれ

しかしここには本気でいつも地震の発生を予知している者がいる。