その後、戦前の鉄道省と戦中の運輸逓信省、戦後の運輸省時代は
Japan Goverment Railways と呼ばれていました。
http://en.wikipedia.org/wiki/Japanese_Government_Railways
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E9%89%84%E9%81%93%E7%9C%81

1949年6月1日に発足した日本国有鉄道は
Japan National Railways でした。
http://en.wikipedia.org/wiki/Japanese_National_Railways
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%97%A5%E6%9C%AC%E5%9B%BD%E6%9C%89%E9%89%84%E9%81%93

現在のJRは、どのような意味があるのか。下記をお読みください。
http://ja.wikipedia.org/wiki/JR
「Japan Railways（ジャパンレールウェイズ=日本諸鉄道）」の頭字語　だそうです。
http://en.wikipedia.org/wiki/Japan_Railways_Group
http://fr.wikipedia.org/wiki/Japan_Railways

では、ドイツ鉄道と比べてみましょう。
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%89%E3%82%A4%E3%83%84%E9%89%84%E9%81%93

Deutsche Bahn AG を略して、DBと呼んでいます。DBは、
旧西ドイツ国鉄（DB, Deutsche Bundesbahn：ドイツ連邦鉄道）
旧東ドイツ国鉄（DR, Deutsche Reichsbahn：ドイツ国有鉄道）
が1994年はじめに統合、民営化されて誕生しました。しかし、事実上は旧の西ドイツ国鉄が、旧の東ドイツ国鉄を吸収合併した模様です。その証拠に、旧の西ドイツ国鉄と、現在のドイツ鉄道の略称は同じ DB です。
日本のJRは、1987年2月20日に名称が公表されましたが、追い込まれた末に苦しまぎれに、やけくそになって名前をつけた感じです。当時、なかなか名称が決まらなくて、どうする? 状態でしたからね。

オランダの鉄道は、国鉄時代と同じ NS (Nederlandse Spoorwegen)です。
日本のJRは、どう見ても不自然な名称だと思います。

では、JR各社の英語による名称はどうなっているのでしょうか。
JR北海道　Hokkaido Railway Company (JR Hokkaidō)
JR東日本　East Japan Railway Company (JR East)
JR東海　　Central Japan Railway Company (JR Central)
JR西日本　West Japan Railway Company (JR West)
JR四国　　Shikoku Railway Company (JR Shikoku)
JR九州　　Kyushu Railway Company (JR Kyūshū)
JR貨物　　Japan Freight Railway Company (JR Freight)

どれもバラバラで、統一性がありません。中でも、日本国内でJR東海と呼ばれている会社が、外国では「中日本鉄道」となっています。外国では、各社が独立していると思っている人は、あまりいません。実際、日本鉄道だと思われています。