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2020年1月、コロナ禍最初期の記事を引用します。
すでに新型コロナウイルスはヘビ由来であることが指摘されていましたが、WHOが否定しました。
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「Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China」
（The Conversation 2020/1/22）
https://theconversation.com/snakes-could-be-the-original-source-of-the-new-coronavirus-outbreak-in-china-130364
「中国で大流行の新型コロナウイルスの発生源はヘビである可能性」
編集部注：この記事の掲載後、世界保健機関は、正確なウイルスの中間宿主は不明であるものの、ヘビがウイルスの発生源であるという「決定的な証拠はない」と発表しています。
今冬、中国で致死的な感染性呼吸器疾患の発生を引き起こした新発見のコロナウイルスの発生源は、ヘビ--中国アマガサヘビと中国コブラ--である可能性がある。
この病気は、2019年12月下旬に中国中部の主要都市である武漢で初めて報告され、急速に広がっている。その後、武漢からの病気の旅行者が中国や米国を含む他の国の人々に感染している。
中国の科学者たちは、患者から分離したウイルスのサンプルを使って、ウイルスの遺伝子コードを決定し、顕微鏡を使って写真を撮影した。このパンデミックの原因となった病原体は、新しいコロナウイルスである。過去17年間に数百人の死者を出した有名な重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（SARS-CoV）や中東呼吸器症候群コロナウイルス（MERS-CoV）と同じウイルス科のウイルスである。世界保健機関（WHO）は、この新型コロナウイルスを「2019-nCoV」と命名した。
私たちはウイルス学者であり、雑誌の編集者でもある。この公衆衛生の脅威の拡大を抑えるために、答えなければならない多くの疑問があるため、このアウトブレイクを注意深く見守っている。
コロナウイルスとは何か？
コロナウイルスの名は、その形状が電子顕微鏡で撮影したときに王冠や太陽コロナに似ていることに由来する。
コロナウイルスは空気感染し、主に哺乳類や鳥類の上気道や消化管に感染する。コロナウイルスの仲間のほとんどは、感染しても軽いインフルエンザ様の症状を引き起こすだけだが、SARS-CoVやMERS-CoVは上気道と下気道の両方に感染し、ヒトに重い呼吸器疾患やその他の合併症を引き起こす可能性がある。
この新型2019-nCoVは、SARS-CoVやMERS-CoVと同様の症状を引き起こす。これらのコロナウイルスに感染した人は、重度の炎症反応に見舞われる。
残念ながら、コロナウイルス感染症に対して承認されたワクチンや抗ウイルス治療薬はない。2019-nCoVの予防と治療のためには、ウイルスの発生源、感染経路、複製の仕方など、そのライフサイクルをより深く理解することが必要である。
人獣共通感染症
SARSもMERSも人獣共通感染症に分類され、最初に感染した患者は動物から直接これらのウイルスを獲得したことになる。これは、動物が宿主である間に、ウイルスが一連の遺伝子変異を獲得し、ヒトの体内で感染・増殖することが可能になったためである。
現在では、これらのウイルスは人から人への感染が可能だ。SARS-CoVとMERS-CoVの感染源はコウモリであり、コウモリとヒトの中間宿主としてそれぞれアジアとアフリカに生息するハクビシンとラクダがいることが野外調査により明らかになった。
この2019年のコロナウイルス集団発生の場合、報告によると、最初に入院した患者グループのほとんどは、加工肉や鶏肉、ロバ、羊、豚、ラクダ、狐、アナグマ、タケネズミ、ハリネズミ、爬虫類などの生きた食用動物も販売している地元の水産卸売市場の労働者や顧客だったとのことだ。しかし、これまで水生動物に感染するコロナウイルスが発見されたという報告はないので、その市場で販売された他の動物に由来するコロナウイルスである可能性がある。
2019-nCoVが市場で動物から感染したという仮説は、Journal of Medical Virologyに掲載された新しい論文によって強く支持されている。科学者たちは、2019-nCoVと他のすべての既知のコロナウイルスの遺伝子配列を比較し、分析を行った。
2019-nCoVの遺伝コードの研究から、この新型ウイルスが中国から採取した2つのコウモリSARS様コロナウイルスと最も近縁であることが明らかになり、SARSやMERSと同様に、2019-nCoVもコウモリが起源である可能性が最初に示唆されました。さらに著者らは、宿主細胞上の受容体を認識するウイルス粒子の「王冠」を形成する2019-nCoVスパイクタンパク質のウイルスRNAコード配列が、コウモリのウイルスが人に感染する前に変異した可能性を示していることを明らかにした。
しかし、2019-nCoVの塩基配列をより詳細にバイオインフォマティクス解析したところ、このコロナウイルスはヘビに由来する可能性が示唆された。
コウモリからヘビへ
研究者らは、新しいコロナウイルスの特徴あるタンパク質コードの分析を行い、鳥、ヘビ、マーモット、ハリネズミ、センザンコウ、コウモリ、ヒトなど、さまざまな動物宿主に見られるコロナウイルスのタンパク質コードと比較した。意外なことに、2019-nCoVのタンパク質コードは、ヘビがもつコードと最も似ていることが判明した。
ヘビは野生でコウモリを獲ることが多い。武漢の地元の海産物市場でヘビが売られていたという報告もあり、このコロナウイルスの発生当初、2019-nCoVが宿主種であるコウモリからヘビ、そしてヒトへとジャンプした可能性がある。しかし、ウイルスがどのようにして冷血性と温血性の両方の宿主に適応できたのかは、依然として謎のままである。
報告書の著者や他の研究者は、実験室実験によってウイルスの起源を検証する必要がある。ヘビに含まれる2019-nCoVの塩基配列を検索することが、まず第一に必要なことだろう。しかし、発生以来、魚介類市場は消毒、閉鎖されており、新型ウイルスの発生源の動物を追跡することは困難である。
ウイルスの起源を確認するためには、市場で売られている動物や野生のヘビやコウモリからウイルスRNAを採取する必要がある。とはいえ、報告された発見は、予防や治療プロトコルを開発するための洞察を与えてくれるだろう。
2019-nCoVの発生は、人獣共通感染症を防ぐために、野生動物の食用利用を制限すべきことを改めて認識させるものだ。
この記事は、ウイルスからの遺伝物質がDNAではなくRNAであることを明確にするために更新された。
「Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China」
（The Conversation 2020/1/22）
https://theconversation.com/snakes-could-be-the-original-source-of-the-new-coronavirus-outbreak-in-china-130364
Editor’s note: Since publication of this article, the World Health Organization has said that there is “no conclusive evidence” that snakes were the source of the virus, although the exact viral intermediate host remains unknown.
Snakes the Chinese krait and the Chinese cobra may be the original source of the newly discovered coronavirus that has triggered an outbreak of a deadly infectious respiratory illness in China this winter.
The illness was first reported in late December 2019 in Wuhan, a major city in central China, and has been rapidly spreading. Since then, sick travelers from Wuhan have infected people in China and other countries, including the United States.
Using samples of the virus isolated from patients, scientists in China have determined the genetic code of the virus and used microscopes to photograph it. The pathogen responsible for this pandemic is a new coronavirus. It’s in the same family of viruses as the well-known severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), which have killed hundreds of people in the past 17 years. The World Health Organization (WHO) has named the new coronavirus 2019-nCoV.
We are virologists and journal editors and are closely following this outbreak because there are many questions that need to be answered to curb the spread of this public health threat.
What is a coronavirus?
The name of coronavirus comes from its shape, which resembles a crown or solar corona when imaged using an electron microscope.
Coronavirus is transmitted through the air and primarily infects the upper respiratory and gastrointestinal tract of mammals and birds. Though most of the members of the coronavirus family only cause mild flu-like symptoms during infection, SARS-CoV and MERS-CoV can infect both upper and lower airways and cause severe respiratory illness and other complications in humans.
This new 2019-nCoV causes similar symptoms to SARS-CoV and MERS-CoV. People infected with these coronaviruses suffer a severe inflammatory response.
Unfortunately, there is no approved vaccine or antiviral treatment available for coronavirus infection. A better understanding of the life cycle of 2019-nCoV, including the source of the virus, how it is transmitted and how it replicates are needed to both prevent and treat the disease.
Zoonotic transmission
Both SARS and MERS are classified as zoonotic viral diseases, meaning the first patients who were infected acquired these viruses directly from animals. This was possible because while in the animal host, the virus had acquired a series of genetic mutations that allowed it to infect and multiply inside humans.
Now these viruses can be transmitted from person to person. Field studies have revealed that the original source of SARS-CoV and MERS-CoV is the bat, and that the masked palm civets (a mammal native to Asia and Africa) and camels, respectively, served as intermediate hosts between bats and humans.
In the case of this 2019 coronavirus outbreak, reports state that most of the first group of patients hospitalized were workers or customers at a local seafood wholesale market which also sold processed meats and live consumable animals including poultry, donkeys, sheep, pigs, camels, foxes, badgers, bamboo rats, hedgehogs and reptiles. However, since no one has ever reported finding a coronavirus infecting aquatic animals, it is plausible that the coronavirus may have originated from other animals sold in that market.
The hypothesis that the 2019-nCoV jumped from an animal at the market is strongly supported by a new publication in the Journal of Medical Virology. The scientists conducted an analysis and compared the genetic sequences of 2019-nCoV and all other known coronaviruses.
The study of the genetic code of 2019-nCoV reveals that the new virus is most closely related to two bat SARS-like coronavirus samples from China, initially suggesting that, like SARS and MERS, the bat might also be the origin of 2019-nCoV. The authors further found that the viral RNA coding sequence of 2019-nCoV spike protein, which forms the “crown” of the virus particle that recognizes the receptor on a host cell, indicates that the bat virus might have mutated before infecting people.
But when the researchers performed a more detailed bioinformatics analysis of the sequence of 2019-nCoV, it suggests that this coronavirus might come from snakes.
From bats to snakes
The researchers used an analysis of the protein codes favored by the new coronavirus and compared it to the protein codes from coronaviruses found in different animal hosts, like birds, snakes, marmots, hedgehogs, manis, bats and humans. Surprisingly, they found that the protein codes in the 2019-nCoV are most similar to those used in snakes.
Snakes often hunt for bats in wild. Reports indicate that snakes were sold in the local seafood market in Wuhan, raising the possibility that the 2019-nCoV might have jumped from the host species bats to snakes and then to humans at the beginning of this coronavirus outbreak. However, how the virus could adapt to both the cold-blooded and warm-blooded hosts remains a mystery.
The authors of the report and other researchers must verify the origin of the virus through laboratory experiments. Searching for the 2019-nCoV sequence in snakes would be the first thing to do. However, since the outbreak, the seafood market has been disinfected and shut down, which makes it challenging to trace the new virus’ source animal.
Sampling viral RNA from animals sold at the market and from wild snakes and bats is needed to confirm the origin of the virus. Nonetheless, the reported findings will also provide insights for developing prevention and treatment protocols.
The 2019-nCoV outbreak is another reminder that people should limit the consumption of wild animals to prevent zoonotic infections.
This article has been updated to clarify that the genetic material from the virus was RNA, not DNA.
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（関連情報）
「[最重要] ブライアン・アーディス博士 『新型コロナの正体は呼吸器系ウイルスではなく、ヘビ毒である』」
（拙稿 2022/4/13）
http://www.asyura2.com/21/iryo8/msg/859.html
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