3790の定量的ポリメラーゼ連鎖反応-陽性サンプルと1941年の重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2分離株を含む陽性細胞培養との… HIMAZIN

3790の定量的ポリメラーゼ連鎖反応-陽性サンプルと1941年の重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2分離株を含む陽性細胞培養との相関（OXFORD ACADEMIC）
http://www.asyura2.com/20/iryo6/msg/603.html
投稿者 HIMAZIN 日時 2021 年 4 月 11 日 13:40:41: OVGN3lMPHO62U　SElNQVpJTg

こちらの記事の機械翻訳。本文のみのため詳細はリンク先でどうぞ。
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https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1491/5912603

こちらの記事で参照されているため、遅まきながら転載。
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ポルトガルの裁判所は、PCR検査がCOVID-19感染を「決定することができない」と判決を下した（RT）
http://www.asyura2.com/20/kokusai29/msg/691.html

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（以下機械翻訳し転載）

3790の定量的ポリメラーゼ連鎖反応-陽性サンプルと1941年の重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2分離株を含む陽性細胞培養との相関

Clinical Infectious Diseases, ciaa1491, https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1491
Published:
28 September 2020

編集者へ—重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）によるコロナウイルス病2019（COVID-19）のパンデミックの発生は、2020年3月12日に世界保健機関によってパンデミックと宣言されました[1]。アウトブレイクに関連する主要な問題は、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（RT-PCR）後に得られ、サイクルしきい値（Ct）として表されるウイルスRNA負荷を伝染性と相関させることであり、したがって、接触からの排除および特殊な感染症からの退院の期間病棟。 100以上の研究に基づいた最近のいくつかの出版物は、カットオフCt値と立ち退き期間を提案しようと試みており、コンセンサスはそれぞれ約Ct> 30日と少なくとも10日です[2–5]。しかし、Clinical Infectious Diseasesに掲載された記事で、Bullard et alは、この値を超える培養ではウイルスが検出されないため、患者がCt> 25で伝染する可能性はないと報告しました[6]。この制限は、フランスのメディアで、フランス科学評議会Covid-19のメンバーとのインタビュー中に、それを超えると患者が伝染しなくなる可能性のある値として引き起こされました[7]。

発生の初めに、E遺伝子の増幅と培養の結果に基づいてPCR技術を使用して得られたCt値を相関させました[8]。パンデミックが始まって以来、179151人の患者に対して250566のSARS-CoV-2RT-PCRを実施し、そのうち13 161（7.3％）が陽性でした。 5月末までに、鼻咽頭サンプルで陽性と報告されたこれらのサンプルのうち3790が接種され、前述のように培養のために管理されました[8]。これらの3790の接種サンプルのうち、1941のSARS-CoV-2分離株は、最初の接種後または最大2回のブラインド継代培養後に取得できました。スキャナー値と培養の陽性率との相関関係により、予備作業（1941対129）の10倍の分離株で得られた画像が大幅に変化しないことを観察できます（図1）。 Ct = 25では最大70％の患者が培養陽性のままであり、Ct = 30ではこの値が20％に低下することが観察できます。 PCRの陽性結果を報告するために使用した値であるCt = 35では、培養物の3％未満が陽性です。私たちのCt値35は、最初は私たちの研究室のコントロールネガティブサンプルでRT-PCRによって得られた結果と培養の最初の結果に基づいており[8]、ここに提示された結果によって検証され、韓国で提案されたものと相関しています[8]。 9]および台湾[10]。継代培養、特に最初の継代培養では、Ct値のあるサンプルでウイルス分離の割合が増加することが観察され、これらの高いCt値が低いウイルス量とほとんど相関していることが確認されました。私たちのコホートから、PCRが10日を超えて陽性である場合、多くの場合Ct> 30であるまれなケースでは、ケースバイケースで患者の生ウイルス排出の期間と頻度を理解して定義する必要があります。。いずれにせよ、これらのまれなケースは公衆衛生上の決定に影響を与えるべきではありません。　

1. ＡＮ[1863] gmCCbQ 2021年4月11日 17:48:32 : 7TkzMLzxKM : cGh5emt2eldjV2M=[370] 報告

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この論文は、
　「COVID-19陽性者の試料を細胞培養して感染を起こすかどうか試験した」
もので、その超要旨は、
　「１.”リアルタイムＰＣＲのＣｔ値は感染力（すなわち試料中のウイルス量）と逆の相関をする”という従来と同じ結論が得られた。
　２.ＰＣＲが１０日を超えて陽性で、Ｃｔ＞３０であるまれなケースでは、公衆衛生上の決定に影響を与えるべきではありません」
というものです（と小生は読みました）。

　結論１.には異議ありませんが、結論２.は判断が難しいです。なぜなら図を見れば分かるように、感染力の曲線はなだらかに下がっていて、”どこで線を引くか”は難しいことが一つ。２つ目は、これはあくまでも試験管の中での培養実験で、材料として Vero 細胞（アフリカミドリザルの腎臓から不死化した細胞）を用いており、実際のヒトの組織に対する感染と同様に考えて良いかどうかは、また別問題だからです。